在宝山工商注册公司后，妥善处理商业机密至关重要。公司的商业机密包括各种敏感信息，如客户资料、财务数据、研发成果等，对这些信息的保护不仅关乎公司的核心竞争力，也事关企业的长远发展。因此，建立有效的商业机密保护机制是每家公司必须认真对待的任务。

一、加强内部管理

1、设立专门机构负责商业机密的管理，明确责任人和权限范围。

2、建立严格的信息权限制度，对不同层级员工的权限进行分级管理，确保商业机密仅限授权人员访问。

3、制定详细的商业机密保密规定和操作流程，加强员工的保密意识培训，确保员工充分了解保密政策。

4、建立完善的内部审计机制，定期对商业机密的使用情况进行检查和审查，及时发现和纠正违规行为。

5、采用先进的技术手段，如身份认证系统、数据加密技术等，加强对商业机密的保护。

二、加强外部保护

1、签订保密协议：与合作伙伴、供应商、客户等签订保密协议，明确双方在商业合作中的保密义务。

2、加强网络安全：建立健全的网络安全系统，防范黑客攻击、病毒侵袭等网络威胁，保护公司的网络数据安全。

3、控制信息流出：严格管控员工的外部通讯和信息传递行为，防止商业机密通过邮件、社交媒体等途径外泄。

4、加强对外宣传的管理：在对外宣传中注意保密，避免意外泄露公司敏感信息。

5、建立紧密的政府关系：与政府相关部门建立良好的合作关系，获取政府的支持和保护，提高公司商业机密的安全性。

三、建立知识产权保护体系

1、及时申请专利：对公司的核心技术和创新成果进行专利申请，确保公司在法律上的权益。

2、注册商标：注册公司的商标，确保公司的品牌形象和商誉不受侵害。

3、加强版权保护：对公司的软件、文档、设计图等作品进行版权保护，防止他人未经授权复制或使用。

4、加强培训和宣传：加强员工的知识产权保护意识培训，提高员工对知识产权的重视程度。

5、建立专门部门：设立知识产权保护部门，负责公司知识产权的管理和维护工作。

四、建立应急预案

1、制定应急预案：针对商业机密泄露、网络攻击等突发事件，制定详细的应急预案，确保在危机发生时能够迅速有效地应对。

2、定期演练：定期组织商业机密保护演练，检验应急预案的有效性，提高员工应对突发事件的能力。

3、建立报告机制：建立商业机密泄露事件的报告机制，确保信息能够及时上报并得到有效处理。

4、持续改进：根据演练和事件处理情况，不断完善应急预案，提高应对突发事件的能力。

5、加强监控和预警：利用先进的监控技术和预警系统，及时发现并应对潜在的安全威胁。

综上所述，宝山工商注册后，有效处理公司的商业机密至关重要。加强内部管理、加强外部保护、建立知识产权保护体系以及建立应急预案是保护商业机密的关键措施。同时，公司需要不断改进和完善商业机密保护机制，提高对商业机密安全的重视程度，确保公司的长期发展和竞争优势。